相对于其它生物特征鉴定技术例如语音识别及视网膜识别，指纹识别是一种更为理想的身份确认技术。
一、每个人的指纹是独一无二，两人之间不存在着相同的手指指纹。19世纪末，英国学者亨利写出了专著，将指纹的特征及识别原理加以分析归纳，科学地提出了人的指纹各不相同，并提出了基于指纹特征特征进行识别的原理和方法，以后衍生出的各种识别方法都是基于该理论。按亨利的理论，一般人的指纹在出生后9个月得以成型并终身不变；
每个指纹一般都有70-150个基本特征点。从概率学的角度，在两枚指纹中只要有12-13个特征点吻合，即可认定为同一指纹。按现有人口计算，上述概率120年才可出现两枚完全相同的指纹。
二、每个人的指纹是相当固定的，很难发生变化。例如，指纹不会随着人的年龄的增长、或身体健康程度的变化而变化。人的声音却有着较大的变化.
三、便于获取指纹样本，易于开发识别系统，实用性强。目前已有标准的指纹样本库，方便了识别系统的软件开发；另外，识别系统中完成指纹采样功能的硬件部分（即指纹采集仪）也较易实现。而对视网膜则难于采样，也无标准的视网膜样本库供系统软件开发使用，这就导致视网膜识别系统难以开发，可行性较低.
四、一个人的十指指纹皆不相同，这样，可以方便地利用多个指纹构成多重口令，提高系统的安全性。同时，并不增加系统的设计负担。
五、指纹识别中使用的模板并非最初的指纹图，而是由指纹图中提取的关键特征，这样使系统对模板库的存储量较小。另外，对输入的指纹图提取关键特征后，可以大大减少网络传输的负担，便于实现异地确认，支持计算机的网络功能。
从以上的分析可以看到，用自动指纹识别相对于其它方法不仅具有许多独到的信息安全角度的优点，更重要的是还具有很高的实用实用性、可行性。
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